「思い出して、翅(はね)があったころのことを」rn 1万2千年前の想いに応え、繋がったのは欠けたこころ。rn 太陽と月と火星が出会うとき、新たな合体の調べが流れる──!rn 湘南の海に浮かぶ小島、江の島。rn 美しくのどかなその浜辺に、〈私立江ノ島学園〉はある。rn 学園には、全国から優秀な子どもが集められ、rn 最新の機器を使った英才教育が施されていた。rn 特殊強化クラスの生徒〈エレメント〉に選ばれたサッコ、リミヤ、トシは、rn 感情の力で動く戦闘機〈ベクターマシン〉の操縦を命じられ、rn 謎の侵略兵器〈神話獣〉との戦いを余儀なくされる。rn 戦いのさなか、不可思議なヴィジョンに導かれ、サッコは叫ぶ──。rn 「想星合体! GO、アクエリオン!」rn 繰り返される輪廻の果てに、現れた機械天翅アクエリオン。rn 宿命を背負った少年少女は、rn 得体のしれない団体〈宇宙たまごの会〉や大人たちの思惑が交錯す...